早年間，藥用玻璃瓶因為其抗擊力差、運輸難、笨重、易破碎等問題逐漸被藥用塑料瓶所代替。但是經過二十幾年的實際使用，藥用塑料瓶的安全性逐漸暴露出來。
與玻璃瓶相比，藥用塑料瓶具有輕盈、韌性、可塑性高等優點，但是在安全面前，此類優點顯得微不足道。即使是專業的醫療從事者也不敢保證，藥品在長期的塑料瓶中浸泡，是否會產生其他物質。
目前藥用塑料瓶有兩大障礙。一是價格定位。藥用塑料瓶和玻璃瓶雖然成本相差不多，但是價格卻要比玻璃瓶高，為了利益，無論是藥用塑料瓶廠家還是醫藥機構都不愿意放棄。二是因為玻璃瓶和塑料瓶生產不一，如果放棄藥用塑料瓶，那么就以為這前期的投入扔進了水里。
有專家認為，在安全面前就應該果斷放棄藥用塑料瓶，醫療機構應選用便宜但是安全的玻璃瓶。